История игры начинается в Атлантиде, где адмирал Аркантос пытается восстановить покровительство Посейдона, бога атлантов[20]. Он защищает Атлантиду от нападения пиратов, затем, пустившись за ними в погоню, чтобы вернуть украденный трезубец со статуи Посейдона, отправляется на Троянскую войну, где сражается вместе с Агамемноном. После нескольких сражений Аркантос вместе с Одиссеем и Аяксом разрабатывают план захвата города, включающий Троянского коня. После победы Аркантос и Аякс отправляются в Грецию, чтобы починить корабли к кентавру Хирону. Но добравшись до его мастерских, они обнаруживают, что порт захвачен неизвестными разбойниками. После освобождения Хирон сообщает, что все его люди угнаны в рабство. Вместе они отправляются на север, где находят пленников раскапывающими проход в Преисподнюю под руководством циклопа Гаргаренсиса, управляющего Камосом, предводителем пиратов, стоявшим за нападением на Атлантиду[21]. Герои следуют за ним и доходят до огромных ворот Тартара, которые пытаются разрушить тараном циклопы-слуги Гаргаренсиса. Несмотря на то, что герои не знают, что это за врата, они уничтожают таран, не дав их разрушить. Но Гаргаренсис выбирается наверх, отрезав путь назад, из-за чего герои остаются в подземном мире.

Найдя ближайший выход на поверхность они попадают в Египет, где встречаюся с Нубийской воительницей Аманрой, которая собирает разрозненные части тела Осириса, убитого Сетом, чтобы воскресить убитого. Во время путешествий по Египту за ковчегами с останками Осириса Аркантосу снится сон, в котором Афина рассказывает ему о намерениях Гаргаренсиса освободить из Тартара Кроноса, разрушив одни из врат, чтобы стать бессмертным[17]. Аманра отвоёвывает ковчег у прислужника Гаргаренсиса — жреца Кемсита, Хирон извлекает голову Осириса из священного дерева тамариска, а Аркантос и Аякс убивают предводителя пиратов Камоса, завладевшего последней частью. После проведения обряда Осирис воскресает и уничтожает армию Гаргаренсиса, но последнему удаётся избежать возмездия, отплыв к третьим вратам Тартара в Скандинавию.

По пути на север Аркантос и Аякс находят потерпевшее кораблекрушение судно Одиссея и помогают ему уничтожить Цирцею. Достигнув севера герои встречаются с карликами Брокком и Эйтри, которые решают показать дорогу в Нифльхайм в обмен на защиту своих мастерских от гигантов. По пути они встречают Скалта, старика, поручающего им нести знамя, которое, как он утверждает, должно воссоединить разрозненные кланы, но знамя обладает противоположным эффектом. После того, как Скалт разоблачается, признавшись, что он — воплощение Локи, герои узнают, что Локи помогает Гаргаренсису. Найдя третьи врата в Тартар, герои снова пытаются уничтожить таран Гаргаренсиса, но в ходе сражения погибает Хирон. Слугам Гаргаренсиса удаётся взломать запор врат, но они оказываются запечатанными молотом Тора. Гаргаренсис оказывается разбит, на подмогу героям приходят войска под предводительством Одиссея, и Аякс отрубает голову Гаргаренсису[22] .

Но по прибытии в Атлантиду Аркантос обнаруживает, что голова Гаргаренсиса, которую он вёз в качестве трофея, превратилась в голову Кемсита. Гаргаренсис прибыл в Атлантиду раньше и пытается открыть последние врата, расположенные у главного храма Посейдона. Аркантос строит памятникссылка дана, потому что в игре используется именно это здание в честь Зевса, за что Зевс даёт Аркантосу божественную силу. Аркантос уничтожает оживлённую Гаргаренсисом статую Посейдона, что приводит к затоплению Атлантиды. После смерти Афина превращает Аркантоса в полубога, сделав его бессмертным.