Группа была образована в 1989 году в городе Форт-Лодердейл, штат Флорида, под названием Marilyn Manson and The Spooky Kids. С тех пор состав коллектива неоднократно менялся. Участники, внесшие наиболее значительный вклад в творчество группы и/или пребывавшие в ней длительное время: Дэйзи Берковитц (Скотт Путески), Твигги Рамирез (Джорди Уайт), Джон 5 (Джон Лоури), Тим Сколд, Джинджер Фиш (Кенни Уилсон), Мадонна Уэйн Гейси (Пого) (Стефен Грегори Биер-мл.).
Названием группы стал псевдоним ее вокалиста и бессменного лидера — Мэрилина Мэнсона (Брайан Уорнер). Псевдоним был составлен Уорнером из имени знаменитой американской киноактрисы Мэрилин Монро и фамилии не менее известного маньяка-убийцы Чарльза Мэнсона. Столь необычное соединение, по мысли Уорнера, обладало целым рядом значений, начиная от принципиального утверждения о неизбежности наличия в человеке двух начал (добра и зла) до протеста против того, что «Америка помещает убийц на обложку журнала „Таймс“, делая их столь же знаменитыми, как наших любимых кинозвёзд» (эссе «Колумбина: Чья это вина?»). Все остальные участники группы взяли аналогичные псевдонимы из женских имен и фамилий известных убийц.
Имидж и музыкальный стиль группы меняется от альбома к альбому почти до неузнаваемости, что дает повод причислять ее и к индастриал, и к глэм-року, и к готик-року и даже к нью метал. Несмотря на то, что отдельные элементы перечисленных стилей присутствуют в музыке Marilyn Manson, полностью творчество группы не укладывается ни в одну из заявленных категорий.

В прокладывании пути группе очень помог Трент Резнор (со своим лейблом «Nothing Records») — бессменный участник группы NIN. Наибольший вклад его деятельности в альбомах «Portrait of an American Family» и «Antichrist Superstar», где он выступил продюсером.

Награды
South Florida Slammie Awards:
1993: «Песня года» — «Dope Hat»,
1993: «Группа года»,
1994: «Группа года»,
1996: «Группа года».

Billboard Video Music Award:
1998: «Лучший хард-рок/метал клип» — «The Dope Show»,
1998: «Максимальная награда» — «The Dope Show».

Kerrang! Awards '99:
1999: «Лучшая группа на планете».

MTV Video Music Award:
1999: «Лучшая кинематография» — «The Dope Show».

Kerrang! Awards '00:
2000: «Зал известности».

Kerrang! Awards '01:
2000: Лучший альбом — «Holy Wood».

Kerrang! Awards '02:
2002: «Лучший клип» — «Tainted Love».

Kerrang! Awards '05:
2005: «Икона награждения».

Номинации:

South Florida Slammie Award:
1992: «Группа года»,
1992: «Лучшая группа тяжелой альтернативы».

MTV Video Music Award:
1996: «Лучший хард-рок клип» — «Sweet Dreams (Are Made of This)»,
1997: «Лучший рок-клип» — «The Beautiful People»,
1997: «Лучшие спецэффекты» — «The Beautiful People».

MTV European Music Award:
1998: «Лучший рок-клип» — «The Dope Show»,
1998: «Лучший рок-артист»,
1999: «Лучший рок-артист».

Grammy Award:
1999: «Лучшая хард-рок работа» — «The Dope Show»,
2001: «Лучшая метал-работа» — «Astonishing Panorama Of The Endtimes»,
2004: «Лучшая метал-работа» — «mOBSCENE».

Kerrang! Award:
2003: «Лучший клип» — «mOBSCENE».

ECHO Award 2008:
«Международный Рок»,
«Альтернативный мужчина»,
«Группа года» — «EAT ME, DRINK ME».

-Мэрилин Мэнсон (Marilyn Manson / Brian Hugh Warner) — вокал, автор текстов, клавишные, перкуссия, сочинительство, продюсер и основатель группы — (1989 — по сей день),
-Твигги (Twiggy (раньше Twiggy Ramirez) / Jeordie Osbourne White) — бас-гитара, гитара, бэк-вокал, сочинительство — (1993—2002, 2008 — по сей день),
-Крис Вренна (Chris Vrenna) — клавишные, сэмплинг, перкуссия — (2004 — 5, 2007 — по сей день),
-Фред Саблан (Fred Sablan) — бас-гитара, бэк вокал — (c 2010 года).

1994-"Portrait of an American Family"
Выпущен: July 19, 1994
Лейбл: Nothing, Interscope
Формат: CD, CS,

1996-"Antichrist Superstar"
Выпущен: October 8, 1996
Лейбл: Nothing, Interscope
Формат: CD, CS, LP

1998-"Mechanical Animals"
Выпущен: September 15, 1998
Лейбл: Nothing, Interscope
Формат: CD, CS, LP

2000-"HolyWood"
Выпущен: November 14, 2000
Лейбл: Nothing, Interscope
Формат: CD, CS, LP

2003-"The Golden Age of Grotesque"
Выпущен: May 13, 2003
Лейбл: Nothing, Interscope
Формат: CD

2007-"Eat Me, Drink Me"
Выпущен: June 5, 2007
Лейбл: Interscope
Формат: CD, DI

2009-"The High End of Low"
Выпущен: May 19, 2009
Лейбл: Interscope
Формат: CD, DI.

1999-"The Last Tour on Earth"
Выпущен: November 12, 1999
Лейбл: Nothing, Interscope
Формат: CD, CS

2004-"Lunch Boxes & Choklit Cows"
Выпущен: April 20, 2004
Лейбл: Empire MusicWerks
Формат: CD

2004-"Lest We Forget"
Выпущен: September 28, 2004
Лейбл: Interscope
Формат: CD

2008-"Lost & Found"
Выпущен: May 5, 2008
Лейбл: Polydor
Формат: CD

1994-«Get Your Gunn» ,«Lunchbox»
1995-«Dope Hat»,«Sweet Dreams (Are Made of This)»
1996-«The Beautiful People»
1997-«Tourniquet»,«Man That You Fear»
Cryptorchid»
«Long Hard Road Out of Hell»
1998 «The Dope Show» 1Mechanical Animals
1999 «I Don’t Like the Drugs (But the Drugs Like Me)»,«Rock Is Dead»,«Coma White» ,«Astonishing Panorama of the Endtimes»
2000-«Disposable Teens»
2001-«The Fight Song»,«The Nobodies»
2002-«Tainted Love»
2003-«mOBSCENE»,«This Is the New Shit»
2004-«(s)AINT»,«Personal Jesus»
2007-«Heart-Shaped Glasses (When the Heart Guides the Hand)»,«You and Me and the Devil Makes 3»,«Putting Holes in Happiness»
2009 «We’re from America»,«Arma-goddamn-motherfuckin-geddon»
2011-«I Am Among No One».

1994-"Get Your Gunn","Lunchbox"
1995-"Dope Hat","Sweet Dreams (Are Made of This)"
1996-"The Beautiful People","Tourniquet"
1997-"Man That You Fear","Cryptorchid"
"Long Hard Road Out of Hell"
1998-"Apple of Sodom","I Don't Like the Drugs (But the Drugs Like Me)"
1999-"Rock is Dead","Coma White"
"Astonishing Panorama of the Endtimes"
2000-"Disposable Teens"
2001-"The Fight Song","The Nobodies"
2002-"Tainted Love"
2003-"mOBSCENE","This is the New Shit"
2004-"(s)AINT","Personal Jesus"
2007-"Heart-Shaped Glasses (When the Heart Guides the Hand)",
"Putting Holes in Happiness"
2009-"Arma-Goddamn-Motherfuckin-Geddon","Running to the Edge of the World"

«Время ведьм» — Long Hard Road out of Hell (2011),
«Вампирский засос (Vampires Suck)» — If I Was Your Vampire (Instrumental) (2010),
«Кошелек или жизнь(Trick'r Treat)» — Sweet dreams (2009),
«Звездные врата: Атлантида (Stargate: Atlantis)» — Beautiful People (2009),
«Геймер(Gamer)» — Sweet dreams (are made of this) (2009),
«Макс Пэйн» — If I Was Your Vampire (Instrumental) (2008),
«Кошмар перед Рождеством» — This Is Halloween (2006),
«Cold Fear (игра)» — Use Your Fist and Not Your Mouth (2003),
«Пила 2» — Irresponsible Hate Anthem (Venus Head Trap Mix) (2005),
«Дом восковых фигур» — Dried Up, Tied and Dead to the World (2005),
«Enron. Самые умные в этой комнате» — Sweet Dreams (Are Made Of This) (2005),
«Клубная мания» — La La Song (2003),
«Матрица: Перезагрузка» — This Is the New Shit (2003),
«Обитель зла» — The Fight Song (Slipknot Remix), Resident Evil Main Title Theme, Seizure Of Power, Reunion, Cleansing (2002),
«Королева проклятых» — Redeemer (2002),
«Из ада» — The Nobodies (Wormwood Remix) (2002),
«Недетское кино» — Tainted Love (2001),
«День Святого Валентина» — Valentine’s Day (2001),
The Book Of Shadows: Blair Witch 2 — Suicide Is Painless, Disposable Teens (в фильме) (2000),
Celebrity Deathmatch — Astonishing Panorama of the Endtimes (1999),
«Дом ночных призраков (House on Haunted Hill)» — Sweet dreams (1999),
«Матрица» — Rock Is Dead (1999),
Детройт город рока (Detroit Rock City) — Highway to Hell (1999),
Dead Man on Campus — Golden Years (1998),
«Шоссе в никуда» — Apple of Sodom, I Put a Spell on You (1997),
Части тела (Private Parts) — The Suck for Your Solution (1997),
Nowhere — Kiddie Grinder (Remix) (1997),
«Спаун» — Long Hard Road out of Hell (1997),
Strange Land — Sweet Tooth (1995),
SFW — Get Your Gunn (1994).